MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	GAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006509	GAA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006509	A	6	6	125	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006509	CGT	2	6	149	154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006509	G	6	6	185	190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006509	A	7	7	211	217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006509	TTGT	2	8	253	260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006509	CAGCA	2	10	271	280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_006509	AT	3	6	283	288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006509	A	6	6	627	632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006509	TAG	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006509	GGA	2	6	701	706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006509	GAA	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006509	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006509	GT	3	6	2775	2780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006509	GAA	2	6	2788	2793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006509	CG	3	6	2834	2839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006509	GTT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006509	AGGG	2	8	2862	2869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006509	TCG	2	6	4213	4218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006509	TAT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006509	TGCT	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006509	AAAG	2	8	4261	4268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006509	TGG	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006509	G	6	6	4312	4317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006509	TCG	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006509	GATT	2	8	4411	4418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006509	TAG	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006509	TTA	2	6	4458	4463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006509	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006509	ATT	2	6	4510	4515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006509	ATG	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006509	CTC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_006509	GCC	2	6	4749	4754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_006509	ATA	2	6	4789	4794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006509	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006509	A	6	6	4875	4880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006509	ATTT	2	8	4889	4896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006509	T	6	6	4894	4899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006509	A	6	6	4907	4912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006509	ATC	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006509	GGA	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006509	TAG	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006509	TGG	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006509	ATA	2	6	5121	5126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006509	T	6	6	5134	5139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006509	CCT	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_006509	GTTT	2	8	5148	5155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006509	TCT	2	6	5190	5195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006509	GGT	2	6	6069	6074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006509	T	7	7	6301	6307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006509	CTGT	2	8	6373	6380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006509	TCT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006509	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006509	GGT	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006509	GGC	2	6	6437	6442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006509	ATG	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006509	GACG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006509	ATC	2	6	6956	6961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006509	G	7	7	7075	7081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006509	GGC	2	6	7110	7115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006509	CCT	3	9	7121	7129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_006509	GCCA	2	8	7190	7197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006509	CAA	2	6	7260	7265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006509	AT	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006509	T	6	6	7287	7292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006509	ACA	2	6	7308	7313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006509	GTT	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006509	TTC	3	9	7526	7534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006509	AGA	2	6	7748	7753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006509	TTG	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006509	TGGA	2	8	7773	7780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006509	ATC	2	6	7804	7809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006509	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006509	AAG	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006509	TTC	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006509	AT	4	8	7885	7892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006509	TTA	2	6	7894	7899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006509	AGC	2	6	11586	11591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006509	TCT	2	6	11615	11620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006509	TTTA	2	8	11635	11642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006509	CCT	2	6	13424	13429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006509	CT	3	6	13980	13985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_006509	ATT	2	6	14010	14015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006509	ATT	2	6	14018	14023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006509	ATG	2	6	15660	15665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006509	AAGG	2	8	15681	15688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006509	T	6	6	15713	15718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006509	ACG	2	6	15740	15745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006509	TCA	2	6	15806	15811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006509	T	6	6	15838	15843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006509	GAAA	2	8	15898	15905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006509	CGG	2	6	15948	15953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006509	CAT	2	6	16045	16050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006509	AAT	2	6	17055	17060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006509	A	6	6	17067	17072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006509	A	6	6	17098	17103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006509	TATAT	2	10	17128	17137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006509	ATCA	2	8	17155	17162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006509	GAA	2	6	17172	17177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006509	T	6	6	17179	17184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006509	TA	4	8	17201	17208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006509	TCA	2	6	17219	17224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006509	GCC	2	6	17262	17267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_006509	A	6	6	17359	17364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006509	AT	3	6	17378	17383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006509	TAAT	2	8	17391	17398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006509	CTCC	2	8	18499	18506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_006509	TTG	2	6	19227	19232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006509	GTG	2	6	19280	19285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006509	TTA	2	6	19303	19308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006509	AT	3	6	19325	19330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006509	A	6	6	19343	19348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006509	GAG	2	6	19425	19430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006509	AAG	3	9	19438	19446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006509	AGTCA	2	10	19452	19461	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_006509	TCA	2	6	19477	19482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006509	TGA	2	6	19526	19531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006509	TTG	2	6	19549	19554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006509	TA	3	6	19602	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006509	AAC	2	6	19674	19679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006509	GTT	2	6	19719	19724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006509	TGGCG	2	10	19743	19752	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_006509	A	6	6	19785	19790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006509	TA	3	6	19841	19846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006509	AAC	2	6	19848	19853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006509	AAT	2	6	19912	19917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006509	TCC	2	6	20774	20779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_006509	TTATAA	2	12	20782	20793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006509	A	6	6	27354	27359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006509	TTA	2	6	27363	27368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006509	TAA	3	9	28585	28593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006509	AAC	2	6	28595	28600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006509	ATT	2	6	28618	28623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006509	TAA	2	6	28645	28650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006509	CTCC	2	8	29462	29469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_006509	T	6	6	29470	29475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006509	TAT	2	6	31048	31053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006509	T	6	6	31087	31092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006509	T	6	6	31095	31100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006509	TA	3	6	31108	31113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006509	ATG	2	6	31169	31174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006509	AG	3	6	31222	31227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006509	AAGA	2	8	31257	31264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006509	A	6	6	31294	31299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006509	CCA	2	6	31307	31312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_006509	TCCT	2	8	32239	32246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_006509	A	6	6	32324	32329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006509	ACA	2	6	32350	32355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_006509	AATT	2	8	33739	33746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006509	GAT	2	6	33754	33759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006509	T	7	7	33853	33859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006509	T	7	7	33871	33877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006509	AT	3	6	33882	33887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006509	ATA	2	6	33897	33902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_006509	TCC	2	6	33930	33935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_006509	CCAT	2	8	33937	33944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_006509	ATG	2	6	33945	33950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_006509	AAC	2	6	33951	33956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_006509	AAC	2	6	34047	34052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_006509	GTT	2	6	34067	34072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_006509	A	6	6	34090	34095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_006509	ATA	2	6	35553	35558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_006509	TCC	2	6	35600	35605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_006509	GAA	2	6	35640	35645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_006509	A	7	7	35644	35650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_006509	GTT	2	6	35664	35669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_006509	CAT	2	6	35676	35681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_006509	CA	3	6	35691	35696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_006509	CAAA	2	8	35707	35714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_006509	AAG	2	6	36267	36272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_006509	TCG	2	6	36363	36368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_006509	GGCT	2	8	36397	36404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_006509	CGC	2	6	36409	36414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_006509	TAC	2	6	36438	36443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_006509	CG	3	6	36473	36478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_006509	GAT	2	6	36735	36740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_006509	TCCC	2	8	36758	36765	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
179	NC_006509	GAC	2	6	36767	36772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_006509	ATC	2	6	36917	36922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_006509	GAA	2	6	36980	36985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_006509	GTC	2	6	37067	37072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_006509	CAA	2	6	37148	37153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_006509	GGC	2	6	37156	37161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_006509	T	6	6	37167	37172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_006509	CCG	2	6	37175	37180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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189	NC_006509	GGC	2	6	37271	37276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_006509	GAC	2	6	37312	37317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_006509	GAT	2	6	37389	37394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_006509	TG	3	6	37396	37401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_006509	TC	3	6	38638	38643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
195	NC_006509	TAT	2	6	40278	40283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_006509	CGA	2	6	40401	40406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_006509	CCA	2	6	40442	40447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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200	NC_006509	CT	3	6	40490	40495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.